自主　・　誠実　・　礼儀　・　奉仕

　旧制指宿中学校の校章の一部を変えて採用したもので緑の柏葉三枚を組み合わせて図案化し，その中に「中」の文字を金色で浮出している。
　柏葉のごとく生涯変わらぬまっすぐな心と，真理の追究，友愛を意味している。 

　　　　　作詞　南指宿中選定
　　　　　作曲　迫　田　武　資

　　　１　薩南の　光豊かな丘の上　緑に映ゆる白門は
　　　　　自由の旗を掲げつつ　真理の道を拓きゆく
　　　　　これぞ南指宿中学校

　　　２　若き日の　友の誓は固くして　祖国の明日をにないつつ
　　　　　清き血潮の高鳴りに　希望は紅き花と咲く
　　　　　われら南指宿中学校

　　　３　柏葉の　変わらぬ色をたたえつつ　正しく直き心もて
　　　　　一条の道行く彼方　久遠の光射し出づる
　　　　　かおれ南指宿中学校 

『確かな学力と豊かな心を身につけ，健やかでたくましい身体を備えた生徒を育成する』

行きたくなる学校・品格のある学校

　�@　明るく活気のある新しい学校
　
　�A　落ち着きのあるきれいな学校
　
　�B　生徒一人一人を大切にする学校
　
　�C　保護者や地域から信頼される学校

　�@　自ら判断し，正しい行動をする生徒

　�A　よく考え，真剣に学習する生徒

　�B　心豊かで礼儀正しい生徒

　�C　勤労を尊び，進んで奉仕する生徒

　気候が温暖で，自然に恵まれ，人情厚く，南国的詩情にあふれた夢とロマンの国際観光保養都市を目指す明るい都市にある。鹿児島市の中心街まで約１時間の行程にあるなど，地の利を得，都市感覚も豊かである。
　また，丹波小学校，柳田小学校，県の合同庁舎，市役所，警察署，ＪＲ指宿駅も近く，銀行各種会社，各商店，ホテル等もある市の繁華街を校区としている。 従って校区の住民の教育に対する関心は高く，理解や熱意もあり，進学率は例年９５％以上である。ＰＴＡ活動も活発である。